临床上分为急性及慢性两种。一般以腰痛、尿频、尿急、尿痛为主要临床特点。患者中小儿比成人多，女性比男性多，且易反复发作。慢性及反复感染者可导致肾损害。

泌尿系统感染常见的临床表现有尿道口红肿、刺痛、灼热、有脓性或黏液性分泌物溢出；有不同程度的尿频、尿急、尿痛等症状；生殖器部位有皮疹、结节、水疱或脓疱、溃疡及疣体；可出现浑身不适、乏力、食欲缺乏、腰骶及会阴部酸胀微痛，严重者有发热症状。

泌尿系统感染还可出现排尿异常，主要是尿频、尿急、尿痛，也会有尿失禁和尿潴留。